清河门区位于阜新市西南部，距阜新市中心直线距离为25.18公里。东与义县稍户营子镇隔细河相望，西、南与义县高台子镇相连，北与阜新蒙古族自治县伊吗图镇、蜘蛛山乡接壤。位于东经121°19′29″～121°31′15″，北纬41°41′28″～41°48′48″之间。东望医巫闾山，西依大青山，地处细河两岸，属半丘陵地带。南北长12.6公里，东西宽17.25公里，全区面积98.54平方公里。

清河门区辖2个镇，15个村民委员会，2个街道办事处（2019年11月街道区划调整，4个街道合并为2个街道），13个社区居委会。

河西镇辖邢家屯村、六台村、后窑村、三道壕村、东堡子村、南街村，河西村、7个行政村，17个自然屯；乌龙坝镇辖岭东村、关家屯村、老爷庙村、细河堡村、蒲草泡村、靠边屯村、朱家屯村、吴家窑村8个行政村，22个自然屯；清河街道办事处辖清河社区、变电所社区、芹菜沟社区、水塔社区、山景社区、吕家店社区6个社区；新北街道办事处辖北山社区、西花园社区、东花园社区、中部社区、乌龙社区、北园子社区、新街社区7个社区。