内设机构包括办公室、综合科、法制行政审批服务科、预算科、国库科、行政政法科、科教科、经济建设科、农业农村科、社会保障科、企业科、文化旅游和对外经济贸易科、金融科、政府债务管理科、乡镇财政管理科、资产管理科、会计科、政府采购办公室、绩效管理和监督科、机关党委（人事科）。

所属事业机构包括市财政国库集中支付核算中心、市财政事务中心、市工资统发中心、市财政投资评审中心、市政府债务研究与评估中心。