长沙市疾病预防控制中心是实施政府公共卫生职能的核心专业机构，承担着疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情与健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与控制、健康教育与健康促进、实验室检测分析与评价、技术管理与应用研究等七大职能。始终坚持“预防为主，守护健康”的宗旨，守护着星城人民的健康。自成立以来，作为全市疾病预防控制、卫生检测检验、健康教育、预防医学科研与公共卫生业务指导、技术考核和培训中心，挂牌中南大学、湖南师范大学、南华大学等高校的预防医学教学、科研和实践基地。先后获得全国卫生应急先进集体、全国艾滋病防治工作先进集体、国家人感染H7N9禽流感疫情防控工作突出单位、湖南省抗击新冠肺炎疫情先进集体、湖南省先进基层党组织等荣誉称号。

核定编制232人，截至2022年9月，共在职职工269人（含临聘人员41人），其中专业技术人员229人（占85.13%），高级职称72人（占26.77%）、中级职称86人（占31.97%），博士3人、硕士89人、本科118人，本科及以上学历共210人（占78.07%）。内设18个业务科室和10个职能科室。

全面推进质量管理体系建设，先后通过CNAS国家实验室认可、ISO 9001:2015质量管理体系审核、省级检测检验机构资质认定，拥有国家流感网络实验室、国家碘缺乏病参照实验室、艾滋病检测确证实验室、湖南省人禽流感参比实验室、湖南省分子生物学参比实验室等重点实验室。在全省率先获得职业卫生技术服务机构、食品检验机构、公共场所集中空调通风系统检测评价等资质。实验室建筑面积6000余平方米，拥有各类专业设备1100余台，价值约5600万元，检测能力覆盖16大类684个项目，检验报告在欧美和亚太地区几十个国家互认。

借助国家自然科学基金依托单位、全国省会城市流行病学协作组以及长江中游城市群公共卫生科研协作中心等良好科研平台，学科建设工作取得了长足的发展，卫生检验、流行病学2个学科为长沙市医学重点专科，“长沙市新发传染病检验技术研究所”获批长沙市首批医学研究所称号。近5年，获批国家自然科学基金立项1项，省自然科学基金立项6项，其他省、市科研立项34项；1项课题荣获湖南省科学技术进步奖三等奖，多项课题获湖南省预防医学科学技术奖一、二、三等奖、长沙市科学技术进步二等奖、长沙市自然科学优秀学术成果奖等；获国家发明专利2项；发表科技论文227篇，其中SCI收录26篇。