承担漳州市行政区(东山县、云霄县、诏安县、漳浦县、常山开发区、古雷开发区除外)各类海关管理工作。

下设驻招银办事处（副处级），承担漳州招银开发区招银港各类海关管理工作。

下设机构：办公室（党委办公室）、人事政工科（党委组织宣传部）、法律事务科、综合业务一科、综合业务二科、加工贸易监管科、核查科、产品监管科、稽查科、角美监管科。

派驻机构：驻招银办事处（副处级），内设机构：综合保障科、综合业务科、查验科、口岸监督科。