泰州海事局前身为交通部长江航政管理局高港航政站，成立于1966年4月，隶属于南京航政分局。1984年7月升格为高港航政处，1989年8月更名为高港长江港航监督处，1991年8月改隶镇江长江港航监督局。2001年1月，中华人民共和国江苏泰州海事处挂牌成立。2010年7月，升格为中华人民共和国泰州海事局，负责管辖区水上交通安全监督管理工作，同时承担泰州市水上搜救中心的日常工作。

全局核定公务员编制186名，目前在编职工154人，99%具有大学本科及以上学历，35周岁以下青年职工占比达77.8%，队伍结构年轻化特征明显。

全局共设机关职能部门14个，基层海事处1个（靖江海事处，下辖罗家桥执法大队、丹华港执法大队），基层办事处3个（滨江工业园区办事处、高港办事处、泰兴办事处），监管救助基地1个（永安监管救助基地）。共辖海事趸船7艘、海巡艇10艘（另有在建海巡艇3艘）。