主要职责：负责对除聂拉木县、吉隆县及亚东县以外的日喀则地区的进出境运输工具、货物、行李物品、邮递物品和其他物品以及与锡金、不丹、尼泊尔接壤的约1354公里的边境线实施监督管理。

概况：日喀则海关成立于1974年9月1日，位于西藏自治区日喀则市区，海拔3850米，主要负责对除聂拉木县、吉隆县及亚东县以外的日喀则地区的进出境运输工具、货物、行李物品、邮递物品和其他物品以及与锡金、不丹、尼泊尔接壤的约1354公里的边境线实施监督管理。日喀则海关内设3个科室，分别为办公室、综合业务科、监管科。现有关员22名。2019年机构改革，日喀则海关功能类型为偏属地综合型海关，目前正在推进中转型中心海关试点建设工作。

近年来，日喀则海关先后被评为“全区学雷锋服务最佳志愿服务组织”、全国“最佳志愿者服务组织”、自治区级优秀“青年之家”等称号。

内设机构：办公室、监管科、综合业务科。