机构职能：负责昆明长水机场口岸的海关监管业务（含旅航检及各项检验检疫业务）。

机构设置：内设有办公室（党委办公室）、人事政工科（党委组织宣传部）、综合保障科、技术科、综合业务科、口岸监管一科、口岸监管二科、旅检一科、旅检二科、旅检三科、旅检四科、综合值机科、卫生监督科13个科室及1个缉私分局。