成都双流机场海关是受成都海关直接领导，按授权负责成都双流国际机场口岸及成都空港保税物流中心（B型）范围内海关各类管理工作的执行机构。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成成都海关交办的其他工作。

机构设置

设科级机构16个：办公室（党委办公室）、人事政工科（党委组织宣传部）、财装科、物流监控科、综合业务科、监管一科、监管二科、监管三科、旅检总控科、旅检一科、旅检二科、旅检三科、旅检四科、值机科、食品卫生监督科、公共卫生监督科。