恩平海关是受江门海关直接领导，按授权负责江门市下辖恩平市开放口岸和恩平市内海关各类管理工作的执行机构。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成江门海关交办的其他工作。

机构设置：办公室（党委组织宣传部）、综合业务科、稽查科、查检科。