机关职能：穗东海关是受黄埔海关直接领导，按授权负责办理辖区范围内通关监管、加工贸易监管、特殊监管区域监管、企业管理、跨境电商等业务。监管范围为黄埔区、广州开发区，包括了广州经济技术开发区、广州黄埔综合保税区、广州高新技术产业开发区（科学城）、中新广州知识城等区域。

    机构设置及职责： 办公室（党委办公室）、人事政工科（党委组织宣传部）、财务科、后勤技术科、法规科、监控管理科、综合业务一科、综合业务二科、保税加工监管科、保税物流监管科、出口加工区监管科、政务中心业务科、中新知识城监管科（综保区监管一科）、综保区监管二科、查验科、电商业务监管一科、电商业务监管二科、企业属地管理科、处置科。