机构职能：广州车站海关是受广州海关直接领导，按授权负责广州铁路口岸（含大朗车站）范围内海关各类管理工作的正处级隶属海关，主要负责党的基层建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成广州海关交办的其他工作。

机构设置：办公室（党委办公室）、人事政工科（党委组织宣传部）、财务装备科、综合业务科、分析预警科、卫生检疫科、旅检一科、旅检二科、旅检三科、监管科。