中华人民共和国焦作海关，机构规格正处级，2009年8月2日，经国务院批准设立焦作海关；2012年12月23日，海关总署批复同意焦作海关开关。2018年，根据机构改革部署，原出入境检验检疫管理职责和队伍划入海关，经中央编办、海关总署批准，设立焦作海关。下设科级机构4个，分别为：办公室（党委组织宣传部）、综合业务一科、综合业务二科、查检一科、查检二科。

焦作海关受郑州海关直接领导，属地型海关，按授权负责焦作市区域范围内海关各类管理工作的执行。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成郑州海关交办的其他工作。