中华人民共和国新郑海关，机构规格正处级，前身为郑州综合保税区海关，2018年机构改革后，经中央编办、海关总署批准，正式改设为新郑海关。内设科级机构8个，分别为：办公室（党委组织宣传部）、综合业务一科、综合业务二科、物流监控科、备案核销科、监管科、查检一科、查检二科。

新郑海关受郑州海关直接领导，偏属地综合型海关，业务管辖范围由郑州新郑综合保税区调整为郑州航空港经济综合实验区（不含郑州航空口岸），按授权负责管辖范围内海关各类管理工作的执行。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成郑州海关交办的其他工作。