洋山海关，机构级别为正处级，主要承担临港新片区先行启动区（含洋山特殊综合保税区）各项海关业务。

机构设置：办公室、行财科、人事政工科、督审科、群团科、综合业务一科、综合业务二科、综合业务三科、综合业务四科、综合业务五科、物流监控一科、物流监控二科、物流监控三科、物流监控四科、物流监控五科、物流监控六科、物流监控七科、查验一科、查验二科、查验三科、查验四科、查验五科、查验六科、技术检查科、企业管理和稽查科、船舶监管科、法制科、技术科。