长春绿园海关是受长春海关直接领导，按授权负责指定区域范围内海关各类管理工作的执行机构。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成长春海关交办的其他工作。

　　 机构规格为正处级，机构类型为属地型，管辖范围为：负责吉林省行政区划内依照有关规定实施集约化管理的审批备案业务和稽查业务。

内设机构

　　 长春绿园海关设下列14个正科级内设机构：长春绿园海关设下列14个正科级内设机构：办公室（党委办公室）、人事政工科（党委组织宣传部）、保税核批科、减免税核批科、企业管理科、非贸核批科、检验检疫审批科、稽查一科、稽查二科、稽查三科、稽查四科、稽查五科、审核科、综合业务科。