鲅鱼圈海关是受大连海关直接领导的正处级隶属海关。功能类型为偏口岸综合型，管辖范围为：营口港口岸鲅鱼圈港区、仙人岛港区和营口市鲅鱼圈区、盖州市。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成大连海关交办的其他工作。

中华人民共和国鲅鱼圈海关驻仙人岛办事处（以下简称驻仙人岛办事处）是受鲅鱼圈海关直接领导的副处级派驻机构。功能类型为口岸型，按授权负责营口港仙人岛港区海关各类管理工作。

按照国务院机构改革工作部署，原出入境检验检疫职能和队伍划入海关。截至目前，新鲅鱼圈海关内设机构和人员已调整到位。新鲅鱼圈海关是受大连海关直接领导的正处级隶属海关。功能类型为偏口岸综合型，管辖范围为：营口港口岸鲅鱼圈港区、仙人岛港区和营口市鲅鱼圈区、盖州市。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成大连海关交办的其他工作。

中华人民共和国鲅鱼圈海关驻仙人岛办事处（以下简称驻仙人岛办事处）是受鲅鱼圈海关直接领导的副处级派驻机构。功能类型为口岸型，按授权负责营口港仙人岛港区海关各类管理工作。

新鲅鱼圈海关内设办公室（党委办公室）、人事政工科（党委组织宣传部）、综合保障科、综合业务科、物流监控科、保税物流监管科、查验一科、查验二科、查验三科、查验四科、查验五科、望海码头监管科、检疫监管科、旅检科、加工贸易科、企业管理科、业务监控科、业务规范科、驻仙人岛办事处综合科、驻仙人岛办事处监管一科、驻仙人岛办事处监管二科21个正科级机构。

按照机构改革要求，我关结合具体情况对各内设机构的工作职责进行了合理划分，原鲅鱼圈出入境检验检疫局和原鲅鱼圈海关各科室工作内容已重新整合优化。为便于企业办理进出口通关手续，现将涉企相关的处科室名称、简要职责、办公地点及时间予以公布。