丽水海关依照《中华人民共和国海关法》等法律法规，承担通关监管、税收征管、加工贸易和保税监管、海关统计、海关稽查、打击走私、出入境卫生检疫、动植物检疫、进出口商品检验、鉴定、认证和监督管理、出入境人员体检等职责。

单位概况： 丽水海关于2007年11月28日正式开关，业务管辖范围为丽水市全境，辖区土地面积17298平方公里。2018年3月出入境检验检疫管理职责和队伍划入海关，2019年1月机构转隶后的丽水海关正式对外办公。共有5个办公点，人民街办公区（关本部）、城北街办公区（技术中心和保健中心）、龙泉办公点、缙云办公点和青田办公点。

机构设置：内设科室11个：办公室、综合业务一科、综合业务二科、综合业务三科、查检一科、查检二科、查检三科、查检四科、企业管理和稽查科、科技科、缉私科。下辖技术中心和保健中心两个事业单位。