1996 年5 月16 日，“上海海上安全监督局金山监督站”挂牌成立。根据交通部《关于转发中央机构编制委员会办公室〈关于交通部沿海直属海事机构的分支机构设置的批复〉的通知》（交人劳发【2000】296 号）要求，2000 年9 月29 日，更名为“中华人民共和国上海金山海事处 ”，正处级。2013年6月正式更名为“中华人民共和国金山海事局”。在上海海事局的直接领导下，依据国家有关的法律和法规，负责辖区的水上交通安全监督和防治船舶污染海洋环境管理工作。

金山海事局辖区地处金丝娘桥（上海、浙江陆域分界处）所在经线以东，东经121金丝娘桥（上海、浙江陆域分界处）所在经线以东，东经121° 40′以西，金山航道以北（含金山航道）范围内水域。岸线长度49.5 公里，水域面积943 平方公里。辖区沿岸坐落有上海化学工业区、上海石化股份有限公司、上海上电漕泾发电有限公司、奉贤碧海金沙旅游区、金山城市沙滩旅游区。