食品流通许可证，是对食品流通许可证的发放、发放条件、发放程序以及与食品卫生许可证的衔接等问题予以明确。2014年10月23日之前，国务院规定对食品经营者必须坚持先证后照，未取得前置审批文件，不得办理注册登记手续。2014年10月23日，国务院通过关于取消和调整一批行政审批项目等事项的决定（国发〔2014〕50号），改为后置审批，规定对食品经营者必须先照后证。
己废止，各地工商管理部门应不再办理发放新证。2015年11月10日，国家工商行政管理总局发布关于废止《流通环节食品安全监督管理办法》和《食品流通许可证管理办法》的决定（国家工商行政管理总局令第79号），决定废止《食品流通许可证管理办法》（2009年7月30日国家工商行政管理总局令第44号）。
颁布
2009年6月1日开始施行的食品安全法，我国将于6月1日起正
式启用食品流通许可证，取代已沿用了几十年的食品卫生许可证。卫生部、农业部、质检总局、工商总局、食品药品监管局5部门在食品安全的监管上，以分段管理为主，品种管理为辅，新法对食品安全的监管更为严格，今后不再发放食品卫生许可证，而改由各监管部门分段发放生产、流通许可证和餐饮许可。
国家工商总局也即将颁布《食品流通许可证管理办法》，对食品流通许可证的申请、受理、审核、发放、变更、注销以及许可证的管理等等，进行全面的规定。工商机关将依法履行食品流通主体准入管理职责，为食品经营管理者注册提供优质高效的服务。
2015年11月10日，国家工商行政管理总局发布关于废止《流通环节食品安全监督管理办法》和《食品流通许可证管理办法》的决定（国家工商行政管理总局令第79号），决定废止《食品流通许可证管理办法》（2009年7月30日国家工商行政管理总局令第44号）。
法律法规
依据《中华人民共和国食品安全法》第二十七条的规定，申请领取食品流通许可证条件主要包括四个方面：一是具有与经营的食品品种、数量相适应的食品原料处理和食品加工、包装、贮存等场所，保持该场所环境整洁，并与有毒、有害场所以及其他污染源保持规定的距离；二是具有与生产经营的食品品种、数量相适应的生产经营设备或者设施，有相应的消毒、更衣、盥洗、采光、照明、通风、防腐、防尘、防蝇、防鼠、防虫、洗涤以及处理废水、存放垃圾和废弃物的设备或者设施；三是有食品安全专业技术人员、管理人员和保证食品安全的规章制度；四是具有合理的设备布局和工艺流程，防止待加工食品与直接入口食品、原料与成品交叉污染，避免食品接触有毒物、不洁物。
发展
2012年1到11月，全国工商系统新核发食品流通许可证146.12万个，全国食品经营主体共计达到61
3.38万户。这是记者8日在北京召开的全国工商系统流通环节食品安全监管工作会议上了解到的。
为严把食品市场主体准入关，国家工商行政管理总局于2009年9月发布了《食品流通许可证管理办法》，规定：在流通环节从事食品经营的，应当依法取得食品流通许可。食品经营者在此之前已领取食品卫生许可证的，原许可证继续有效。
截至目前，全国工商系统已累计核发食品流通许可证594.64万个，加上原已领取食品卫生许可证并仍在有效期内的食品经营者，全国持有“两证”的合法食品经营主体总计达到613.38万户。
直至2012年，通过严把食品经营准入关，我国食品经营主体素质有所提高，但仍然存在着总体数量较大，小、散、乱问题突出等问题。
费用
1：食品流通许可证；办理食品流通许可不收取费用(北京市《如何办理食品流通许可》(2011年第三版))。
2：食品流通许可证；检验费用： 按照各省标准执行。
3：食品流通许可证；咨询服务费用:按咨询机构标准执行,一般为1.5-1.8万元。包括企业标准备案咨询费用
许可条件
要求
（一）申请人应当在申请书上签字盖章。新设食品流通经营企业申请许可，该企业的投资人为许可的申请人；已经具有主体资格的企业申请食品经营许可，该企业为申请人；个体工商户申请食品流通许可，本人为许可的申请人。
（二）申请食品流通许可证所提交的材料，应当真实、有效、符合法定形式。申请人应当对其提交材料的真实性负责。
（三）对于食品流通经营者在2009年6月1日前已经取得《食品卫生许可证》的，原许可证在有效期内继续有效，自愿申请换证、原许可证载明事项发生变化或者有效期届满，食品经营者应当按照《食品流通许可证管理办法》的规定提出申请，经审核机关审核后，领取食品流通许可证。
办理条件
（一）申请食品流通许可证，应当提交下列材料：
1.《食品流通许可申请书》；
2.《名称预先核准通知书》复印件；
3.经营场所合法使用的有关证明；
4.负责人的身份证明；
5.委托书以及委托代理人或者指定代表的身份证明；
6.食品安全管理制度；
7.与其经营活动相适应的食品经营设备清单；
8.提供食品从业人员健康证和卫生法规培训证复印件；
9.申请乳制品项目的经营者，还应提交开户行证明和书面声明等；
10.专职或者兼职食品安全管理人员的身份证明（初中以上学历证明和培训合格证明）；
11.工商部门要求提交的其他材料。
（二）已经具有主体资格的经营者在经营项目中申请增加食品流通项目的，需提交营业执照副本原件及复印件，不需提交《名称预先核准通知书》复印件。对营业执照副本原件当场审验后退回。
变更
食品经营者注册公司改变许可事项，应当向原许可机关申请变更食品流通许可。未经许可，不得擅自改变许可事项。 食品经营者向原许可机关申请变更食品流通许可的，应当提交下列申请材料：
食品经营者改变许可事项，应当向原许可机关申请变更食品流通许可。未经许可，不得擅自改变许可事项。
食品经营者向原许可机关申请变更食品流通许可的，应当提交下列申请材料：
（一）《食品流通变更许可申请书》；
（二）《食品流通许可证》正、副本；
（三）与变更食品流通许可事项相关的材料。
食品流通许可的有效期为3年。食品经营者需要延续食品流通许可的有效期的，应当在《食品流通许可证》有效期届满三十日前向原许可机关提出申请，换发《食品流通许可证》。
办理许可证延续的，换发后的《食品流通许可证》编号不变，但发证年份按照实际情况填写，有效期重新计算。
其它
办证：门槛将会大幅提高：据工商人员介绍，相比以前申领卫生许可证，办理“食品流通许可证”门槛将大幅提高。
上海地区食品流通许可证咨询办理机构：上海外高桥医药分销中心有限公司
作用：有望杜绝劣质食品： “食品流通许可证”上岗，原来的卫生许可证还能用吗？据工商执法人员介绍，“新老许可证换代尚需时日，如果经营者在6月1日之前已领取卫生许可证，原证可继续使用。但是，从6月1日开始，新开设的食品经营企业必须办理‘食品流通许可证’。”
发放食品卫生许可证的基本条件：
1、场所基本设施符合卫生要求；
2、从业人员经健康检查和培训合格；
3、卫生制度健全、应当提供的资料齐全；
4、星级饭店（宾馆）应当设有或者落实食品卫生质量检验机构，食品卫生质量检验机构内应当配备经卫生行政部门培训考核后取得合格证书的专业人员。
