区两委办公室设9个内设机构，均为正科级。
负责人：游京樊（区委常委、区管委会党组成员、区两委办主任）
(一)秘书科
办理区委、区管委会及其办公室文电收发、分送、校对、立卷、归档、印鉴、保密工作；承担区委、区管委会及其办公室大型会议的会务组织，区委、区管委会领导同志内外事活动安排等工作；负责区管委会政府信息公开工作，指导协调全区政府信息公开工作。
办公电话：0752-5562002
电子邮箱：mskbw@dayawan.gov.cn
办公时间：星期一至星期五(上午：8：30-12：00；下午：2：00-5：30)法定节假日除外
办公地址：广东省惠州市大亚湾经济技术开发区中兴南路118号管委会行政大楼B401
邮政编码：516081
(二)综合信息科
负责起草以区委、区管委会名义上报市委、市政府的重大事项的有关请示、报告；负责区委、区管委会重要会议的领导讲话稿、重要报告和有关文稿的起草；围绕区委、区管委会的重要工作组织开展调查研究，提出意见和建议；负责收集、综合、整理政府政务信息，向市委、市政府报送有关信息；负责编辑《大亚湾信息》、《工作通讯》等两委内部刊物；负责《中国开发区年鉴》、《广东年鉴》、《惠州年鉴》等大亚湾区部分的资料收集和撰稿工作；负责与商务部外贸司、中国开发区协会的联络工作。
办公电话：0752-5562537
电子邮箱：dywzhk@dayawan.gov.cn
办公时间：星期一至星期五(上午：8：30-12：00；下午：2：00-5：30)法定节假日除外
办公地址：广东省惠州市大亚湾经济技术开发区中兴南路118号管委会行政大楼
邮政编码：516081
(三)接待科
负责国家、省、市领导来区检查、指导、考核工作及其他省、市、县(区)领导来区参观考察的接待工作，协调各职能部门接待有关上级视察、检查及调研的接待工作；负责接待经费的财务管理工作，严格执行接待审批、报单、签单等管理制度；负责安排内外来宾的食宿等工作；负责管理接待室、会议室的使用安排和领导办公室的清洁卫生；协调配合有关科室做好重要内外来宾的文字资料和图片资料等文档收集整理工作。
办公电话：0752-5562014
传真：0752-5562014
电子邮箱：lwbjdk5562014105@dayawan.gov.cn
办公时间：星期一至星期五(上午：8：30-12：00；下午：2：00-5：30)法定节假日除外
办公地址：广东省惠州市大亚湾经济技术开发区中兴南路118号管委会行政大楼
邮政编码：516081
(四)行政科
承担机关行政经费预算、决算的汇总、报送及资产处置审核等工作；负责机关基建及其财务管理、机关住房、固定资产的登记管理以及区管委会大院办公用房的产权管理及调配工作；负责区管委会大院的治安保卫、综合治理、消防安全和突发事件的应急处置工作；负责区两委办公室财务、办公设备、物业管理及机关食堂管理工作；协同相关科室做好会议会场的布置和会议的后勤保障工作；负责区委、区管委会有关工作用车的管理、调度、维修与养护工作。
办公电话：0752-5568889
传真：0752-5562022
电子邮箱：dywxzk@dayawan.gov.cn
办公时间：星期一至星期五(上午：8：30-12：00；下午：2：00-5：30)法定节假日除外
办公地址：广东省惠州市大亚湾经济技术开发区中兴南路118号管委会行政大楼B306
邮政编码：516081
(五)统战侨务外事科
负责统一战线各方面的关系；负责联络、组织、协调、处理我区涉港澳台重要活动和重大事件；负责宣传贯彻党和国家有关民族宗教的法律、法规和方针、政策，依法保护公民宗教信仰自由、少数民族权益；负责受理因公出访批件的审核、审批和报批，申办出国(境)的签证(注)，按规定做好外国人入境的审批和管理工作，研究处理有关涉外事宜，督促、检查和协调有关单位的涉外活动；受理华侨、港澳台同胞捐赠物的审核、申报及监督工作；受理华侨回国安置、港澳台同胞回内地定居工作；负责侨联、工商联等工作。
办公电话：0752-5562018
传真：0752-5562018
电子邮箱：wsk@dayawan.gov.cn
办公时间：星期一至星期五(上午：8：30-12：00；下午：2：00-5：30)法定节假日除外
办公地址：广东省惠州市大亚湾经济技术开发区中兴南路118号管委会行政大楼B302室
邮编：516081
(六)保密机要科
（略）
(七)督促检查办公室
负责全区工作会议决定事项执行落实情况的督促检查；负责上级党委、政府重要工作部署和领导的决定、批示交办事项执行落实情况的督促检查；负责区委、区管委会的决策部署、重要文件和区领导同志批示交办事项的执行落实情况的督促检查；负责重大工程和项目进展情况的督促检查；组织办理人大代表议案、建议及政协提案。
办公电话：0752-5562411
电子邮箱：dywdcb@dayawan.gov.cn
办公时间：星期一至星期五(上午：8：30-12：00；下午：2：00-5：30)法定节假日除外
办公地址：广东省惠州市大亚湾经济技术开发区中兴南路118号管委会行政大楼4楼督查办办公室
邮政编码：516081
(八)法制科(区法制局)
贯彻执行法律、法规、规章和国家、省、市有关政府法制工作的方针、政策，起草或组织起草、修改、审核报请区管委会审批的规范性文件草案；承办区管委会交办的重要行政措施发布前的合法性审查；负责编纂、解释、审查、清理区管委会规范性文件，负责区管委会规范性文件上报备案工作；承办向区管委会申请的行政复议、行政赔偿、行政执法投诉案件及代理区管委会行政应诉事务；承办区管委会实施或决定实施的行政处罚及重大行政处罚的上报备案工作；组织或参与组织法律、法规、规章执行情况的监督检查；负责办理行政执法监督中的具体工作，组织建立和推行行政执法责任制、评议考核制；具体组织行政执法人员法律知识培训班；承办行政执法证申报和审核工作；负责牵头组织、协调、监督、指导全区治理公路“三乱”工作。
办公电话：0752-5562038
传真：0752-5562038
电子邮箱：lwbfzk@dayawan.gov.cn
办公时间：星期一至星期五(上午：8：30-12：00；下午：2：00-5：30)法定节假日除外
办公地址：广东省惠州市大亚湾经济技术开发区中兴南路118号管委会行政大楼B412
邮政编码：516081
(九)组织人事科(机关党委办公室)
负责机关和指导直属单位的人事管理、机构编制、教育培训、劳动工资、社会保障、党群、计划生育和离退休人员服务工作；协助相关科室做好本办文电、会务等机关日常工作；负责以本办名义组织的各类文体活动的策划实施工作。
办公电话：0752-5562561、0752-5562382
电子邮箱：lwbzzrsk@dayawan.gov.cn
办公时间：星期一至星期五(上午：8：30-12：00；下午：2：00-5：30)法定节假日除外
办公地址： 广东省惠州市大亚湾经济技术开发区中兴南路118号管委会行政大楼D300
邮政编码：516081
