江源区卫生健康局位于江源大街爱民路203号，承担着全区医疗卫生、预防保健、卫生行政执法、健康教育等行政管理工作。卫生健康局内设综合（安全生产监督管理）、医政医管医改行政审批（中医药管理科）、疾病预防控制职业健康与综合监督和基层卫生与老龄妇幼家庭发展4个科室，机关行政编制12名，局长1名，副局长2名，内设领导职数5名。有公立卫生医疗机构20家。其中，公立医院2家，乡镇卫生院7所，社区卫生服务中心4所，全额事业单位5家（妇幼保健院、疾控预防中心、爱国卫生监督队、监督所、老龄委）。民营医疗机构4家（倪太医院、泰康医院、血栓病防治康复医院、湾沟林区医院），村卫生室60所，个体诊所80家。在编人员738人，空编242个。