横琴粤澳深度合作区统计局主要有以下职责：

（一）负责贯彻执行统计工作的方针政策和法律法规；

（二）负责核算合作区生产总值，汇编提供国民经济核算资料；

（三）负责组织实施合作区人口、经济等重大情况普查，汇总、整理和提供有关方面的统计数据；

（四）负责组织实施行业统计调查；

（五）负责创新国民经济相关数据统计方式，研究编制合作区促进澳门经济适度多元发展的指标体系；

（六）负责组织对合作区建设及促进澳门经济适度多元发展成效开展年度评估；

（七）负责完成执委会交办的其他工作。