横琴粤澳深度合作区行政事务局主要有以下职责：

（一）负责执委会文电、会务活动、机要档案、保密等日常运转工作，承担协调联络工作；

（二）负责执委会人事管理、机构编制、薪酬福利、教育培训、考核奖惩等工作；

（三）负责执委会公共关系、新闻宣传、政务公开及接待工作；

（四）负责执委会综合后勤保障及行政事务局内部管理工作；

（五）承担横琴粤澳深度合作区管理委员会（下称“管委会”）秘书处具体工作，负责管委会、执委会的会议筹备、议题管理和跟踪协调管委会、执委会决定事项的落实；

（六）负责完成执委会交办的其他工作。