孝南区审计局是区政府工作部门，为正科级。区委审计委员会办公室设在区审计局，接受区委审计委员会的直接领导，承担区委审计委员会具体工作，研究提出审计领域坚持党的领导、加强党的建设的政策建议，组织研究审计工作规划和重大政策，协调推进和督促落实党中央决策部署、省委和省委审计委员会、市委和市委审计委员会及区委和区委审计委员会工作要求，研究提出年度审计项目计划等有关事项。

区审计局贯彻落实党中央关于审计工作的方针政策和决策部署，落实省委、市委和区委工作要求，在履行职责过程中坚持和加强党对审计工作的集中统一领导。主要职责是：

    一、主管全区审计工作。

    二、贯彻执行国家有关方针政策和审计工作法律法规，起草有关规章草案，拟定区级审计执法、审计管理制度办法并监督执行。

    三、向区委审计委员会提出年度区级预算执行和其他财政收支情况审计报告。

    四、直接审计下列事项，出具审计报告，在法定职权范围内做出审计决定。

    五、按规定对区管党政主要领导干部和其他单位主要负责人实施经济责任审计和自然资源资产离任审计。

    六、组织实施对国家财经法律法规、规章、政策和宏观调控措施执行情况、财政预算管理及国有资产管理使用等与区级财政收支有关的特定事项进行专项审计调查。

    七、依法检查审计决定执行情况，督促整改审计查出的问题，依法办理被审计单位对审计决定提请行政诉讼或区政府裁决中的有关事项，协助配合有关部门查处相关重大案件。

    八、指导和监督内部审计工作，核查社会审计机构对依法属于审计监督对象的单位出具的相关审计报告。

    九、推广信息技术在审计领域的应用，组织建设审计信息系统。

    十、完成区委、区政府交办的其他任务。

    十一、职能转变。

   内设机构

 根据新“三定方案”，孝南区审计局内设机构为：

   一、办公室
   二、综合股（法制与审理股）
   三、财政金融审计股（电子数据审计股、行政事业审计股）
   四、社会保障审计股（农业农村审计股、企业审计股）
   五、基本建设审计股
   六、经济责任审计股
   七、区委审计委员会办公室秘书股