慈口乡政府设3个内设机构:党政综合办公室、经济发展办公室(加挂林长制办公室牌子)、社会事务办公室(加挂卫健办公室牌子)。

设立人民武装部，根据有关规定设共青团、妇联、工会等组织。

各内设机构的职能分别是:

1、党政综合办公室

主要承担党委、人大、政府交办的各项日常工作和社会治安综合治理、社会稳定、工青妇及综合协调工作，督促有关工作的落实。

2、经济发展办公室

主要承担工业、农业、林业、水利和第三产业发展规划、招商引资、公有资产管理等工作，协调与经济发展相关的其他工作。

3、社会事务办公室

主要承担卫生健康、国土资源管理、乡村规划建设、民政、民族宗教、退役军人事务、人社、医保、科教文等工作，协调与社会事务相关的其他工作。