武汉市疾病预防控制中心于2002年12月正式挂牌成立，其前身为武汉市卫生防疫站，始建于1952年9月，是全市疾病预防控制业务技术管理与指导的中心，为市卫健委所属公益一类事业单位。
中心现有行政办公楼1栋，实验楼1栋，建筑面积3.6万平方米；在建综合实验楼项目1个，占地约50亩，总建筑面积5.2万平方米。中心承担五大职责，一是承担传染性疾病和慢性非传染病等预防和控制工作；二是承担突发公共卫生事件和灾害疫情监测预警、分析研判和应急处置工作；三是开展健康影响因素分析监测和病原微生物检验检测；四是开展流行病学调查及应用研究；五是承担公众健康教育、健康促进与疾病预防指导等工作。中心拥有艾滋病确证实验室、国家流感监测网络检测实验室、国家碘缺乏病参照实验室、省食品安全风险监测重点实验室，通过资质认定的检测项目有13大类共596项。
中心现有编制267，在编职工240人，其中专业技术人员221人；高级专业技术人员77人（占比34.84%），博士29人（占比12.08%），硕士121（占比50.42%），人员结构在全国同类城市中排名靠前。有“湖北省政府专项津贴”1人、“湖北省公共卫生领军人才”1人、“湖北省医学青年拔尖人才”1人、“湖北省公共卫生青年拔尖人才”3人、“武汉市有突出贡献中青年专家”2人、“武汉市政府专项津贴”10人、“武汉市‘十百千人才工程’”1人、“黄鹤英才（医疗卫生）计划”4人。
中心秉承“国内一流，中部第一”的发展目标，践行“科技创新，质量至上”的发展战略，大力弘扬“团结、奉献、务实、创新”的文化理念，造就了一支敢于担当、乐于奉献、技术精湛的专业队伍。在“非典”、人感染高致病性禽流感（H5N1、H7N9）、新冠肺炎等疫情处置，应对重大突发公共卫生事件，以及第七届世界军人运动会公共卫生保障等重要的工作中，屡建功勋。防疾病、增寿命、促健康，几代人终日乾乾，为武汉疾控事业奉献青春与汗水；建模式、出经验、创品牌，“武汉模式”、“武汉经验”领跑全国，“武汉数据”、“武汉标本”享誉世界。
中心与时俱进，不断拓宽研究领域与国际交流渠道，积极探索和创新工作模式，加快推进疾病预防控制体系改革，于2020年底开工建设的市疾控中心综合实验楼建设项目，集成P3实验室和动物实验室等，为武汉疫后重建，涅槃重生构建美好蓝图，将全面提升全市疾控机构硬件水平，增强应对重大疫情和突发公共卫生事件的能力。
数十年风雨婆娑，数十年开拓进取。武汉疾控人踌躇满志，蓄势起航，紧抓疾控体系改革发展历史新机遇，勇立潮头，奋楫争先，坚定打造疾控“第一方阵”的崇高信念，坚守建设 “健康城市”的不变承诺。