武邑县审计局为县政府工作部门，规格为正科级。始建于1983年11月24日，1984年1月开始对外办公。

2019年4月，成立了中共武邑县委审计委员会，作为县委议事协调机构，办公室设在武邑县审计局，负责处理委员会日常工作。

2019年，根据《中共衡水市委办公室衡水市人民政府办公室关于印发〈武邑县机构改革方案〉的通知》（衡办字﹝2019﹞4号），经武邑县编委会研究，对县审计局机构编制进行了调整，并以武邑县委办公室、武邑县人民政府办公室关于县审计局职能配置、内设机构和人员编制规定的通知（武办字〔2019〕35号）正式下发。通知明确，县审计局设办公室、项目审计股、财政金融审计股、经济责任审计股等4个内设股室。核定机关编制11名（行政编制8名、锁定事业编制3名）。