办公室。负责机关日常运转和管理工作；承担机关文电、文秘工作；承担会务、督查工作；承担信息、宣传、政务公开和新闻发布工作；承担安全和保密工作；开展对外合作交流；承担资产管理、机关财务及内部审计工作；组织拟订全市医疗保障工作规划；编制医疗保障基金预决算；推进医疗保障公共服务体系建设；负责政策调研、医疗保障数据统计分析工作；推进医疗保障标准化和信息化建设；贯彻落实医疗保障领域地方性法规、规章和标准；承担机关规范性文件合法性审查和清理工作承担行政复议、行政应诉、信访有关工作；负责推进本系统职能转变和放管服改革工作。

待遇保障科(离休军休干部医疗保障科)。贯彻落实郑州市医疗保险、生育保险、离休人员医疗保障、移交政府安置的军队离退休干部医疗保障、药品和医疗服务价格、医疗救助等医疗保障制度的地方性法规和规章草案、政策、规划、标准；组织实施郑州市医疗保障筹资和待遇政策，完善动态调整和区域调剂平衡机制，统筹城乡医疗保障待遇标准，建立健全与筹资水平相适应的待遇调整机制。推进长期护理保险制度改革；承担全市医疗保障经办管理、公共服务体系和信息化建设责任；负责落实郑州市异地就医管理和费用结算政策；建立健全医疗保障关系转移接续制度。

医药服务管理科。贯彻执行国家、省制定的药品、医用耗材、医疗服务项目、医疗服务设施等医保目录，贯彻执行治疗性医院中药制剂目录，贯彻执行乙类目录药品、支付部分费用的诊疗项目的个人负担比例，贯彻执行医保支付标准；贯彻执行国家、省药品和医用耗材的招标采购政策，监督实施全市药品、医用耗材的招标采购。

基金监管科。组织实施郑州市医疗保障基金监督管理办法，建立健全医疗保障基金安全防控机制，对全市医疗保障基金使用情况进行监督；推进医疗保障基金支付方式改革；贯彻执行郑州市药品、医用耗材价格和医疗服务项目、医疗服务设施收费等政策；建立医药服务价格成本调查和成本监审制度，加强对医药服务价格的监督检查；建立医保支付医药服务价格合理确定和动态调整机制，推动建立市场主导的社会医药服务价格形成机制；建立价格信息监测和信息发布制度；贯彻执行郑州市定点医药机构协议和支付管理办法；负责落实门诊规定病种和重特大疾病医疗保障政策；建立健全医疗保障信用评价体系和信息披露制度；监督管理纳入医保范围内的医疗服务行为和医疗费用，依法查处医疗保障领域违法违规行为。

机关党支部。负责机关及所属单位的党群、纪检和老干部工作；承担机关的干部人事、机构编制、教育培训、考核考评等工作。