中华人民共和国三门峡海关，机构规格正处级。2011年3月4日，经中央编办批准设立三门峡海关，2013年7月10日正式对外开办业务。2018年按照中央关于党和国家机构改革的决策部署，原出入境检验检疫职责和队伍划入海关，经中央编办、海关总署批准，设立三门峡海关。下设科级机构3个，分别是：办公室（党委组织宣传部）、综合业务科和查检科。

三门峡海关受郑州海关直接领导，属地型海关，按授权负责三门峡市区域范围内海关各类管理工作的执行。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成郑州海关交办的其他工作。