（一）中华人民共和国德州海关（以下简称“德州海关”）为正处级隶属海关，负责德州市的各项海关管理工作。

（二）正科级内设机构8个：办公室（党委组织宣传部）、综合业务科、稽查科、核查科、企业管理科、保税业务监管科、查检一科、查检二科。

科级机构主要职责

（一）办公室（党委组织宣传部）：负责政务处理，信息宣传，信访接待，值班应急，对外联系，党建政工，人事教育，财务管理，后勤保障，内控督审等工作。

（二）综合业务科：负责综合业务，关税征管，现场验估，统计，原产地，进出境物品，海关监管车辆管理，通受通办，“CCC”免办，检疫许可证办理，法制，科技等工作。

（三）稽查科：负责稽查作业（企业稽查、贸易调查），缉私行政执法，侵犯知识产权案件查处等工作。

（四）核查科：负责核查作业，强制性产品认证行政执法和自愿性认证行政监管，出境食品、动植物及其产品生产加工存放企业日常监管等工作。

（五）企业管理科：负责企业资质管理，信用管理等工作。

（六）保税业务监管科：负责风险管理，减免税，税政调研，技术性贸易措施，加工贸易及保税监管，海关特殊监管区域（场所）管理等工作。

（七）查检一科：负责海关监管作业场所管理，进出口危险化学品及包装查检，进出口轻纺机电产品查检，进出境动植物查检，国门生物安全监测等工作。

（八）查检二科：负责转关管理，进出口食品查检，口岸传染病疫情和突发公共卫生事件应对，口岸及输入性病媒生物预防控制等工作。