机构职能：负责九江市辖区内海关各类管理工作。主要负责本单位党的基层组织建设和干部队伍建设；办理九江市辖区内和指定口岸等具体海关业务，反馈执法作业结果。

机构设置：办公室（党委办公室、党委宣传部）、综合保障科（党委组织部）、综合业务一科、综合业务二科、物流监控科、查检一科、查检二科、查检三科、稽核一科、稽核二科。