杨浦区疾病预防控制中心是2000年2月24日由原杨浦区卫生防疫站转制后建成，是政府实施疾病预防控制、公共卫生技术管理和服务的全额拨款的公益性事业单位，承担辖区内130多万人口的疾病预防与控制、疫情收集与报告、应急预警与处置、监测检验与评价、健康教育与促进、科学研究与应用、技术指导与管理、技术支撑与服务等工作，已通过国家实验室认可和计量认证，可开展11大类、442项检验检测项目。区疾控中心2007年迁入区公共卫生中心大楼，占地面积1086平方米，固定资产4千余万元，内设17个科室，其中5个职能科室、12个业务科室。区疾控中心目前已成为海洋大学（原水产大学）食品学院、同济大学医学院、蚌埠医学院、上海中医药大学营养系等多家高校的教学实习基地，同时也是兰州大学公共卫生学院、海军军医大学海医系的科研实践基地。