为全面体现政府公共卫生职能，适应疾病谱和医学模式改变，扩大疾病预防控制功能，增强城市公共卫生应急能力，优化卫生防病资源，提高公共卫生科技水平，1998年11月，在市委、市政府的重视下，上海按照预防归口、综合管理、网络统一、上下对口、机构整合、功能重组的原则，在原上海市防疫站基础上，实质性合并市劳动卫生职业病防治研究所、市寄生虫病防治研究所、市结核病防治中心、市皮肤病性病防治中心以及市肿瘤防治研究办公室、市心脑血管疾病防治研究办公室，在全国范围内率先组建成立了第一个省级疾病预防控制中心――上海市疾病预防控制中心，同时挂牌成立了市预防医学研究院。
上海市疾病预防控制中心是实施市政府卫生防病职能的公共卫生核心专业机构，集疾病预防控制与应急、监测检验与评价、应用科研与指导、技术管理与服务、综合防治与健康促进为一体，旨在预防和控制危险因素、疾病、伤害和失能，提高全人群健康水平和生命质量。在继续加强传染病预防控制的同时，积极开展对慢性非传染性疾病和健康危害因素的预防控制，重点加强疾病预防的技术决策、信息综合、防治实施、应用研究和预防服务等功能。按预防医学专业设置传染病防治部、慢性病防治部、环境职业卫生部以及下属的多个专业科室。
近年来，为了强化政府职能，突出政府卫生防病职能的核心任务，体现专业学科基础与行政管理实施的融合，上海市疾病预防控制中心先后设置了公共卫生应急处置办公室、传染病防治管理办公室、信息管理办公室等综合业务管理部门，建立起上接政府、中联专业科室、下达社区的高效业务管理机制，增强社会管理功能和疾病预防控制综合能力。
【定位和宗旨】
上海市疾病预防控制中心是实施政府公共卫生职能的核心专业机构，是城市卫生安全体系的重要组成部分；是在市政府卫生行政部门领导下，组织实施全市卫生防病工作的技术保障部门，同时承担对区县防治机构的业务指导、考核和技术示范职能。
上海市疾病预防控制中心以预防控制健康危险因素、疾病、伤害和失能，提高全市人民健康水平和生命质量，促进经济社会可持续发展为己任。
【基本任务】
实施疾病预防控制
追踪健康相关因素
应对突发公共卫生事件
开展预防医学应用研究
推进国际合作与交流
【主要功能】
决策咨询
拟定疾病防治策略、措施、规划、技术方案、标准和规范。
信息综合
实施疾病与危险因素监测、预警，开展健康水平、干预措施动态评估。
防治实施
制定实施疾病防治计划，开展技术指导、专业培训、质量控制和效果评估。
科学研究
以公共卫生政策、疾病预防控制策略、疾病防治措施和技术方法为重点，组织开展预防医学应用研究。
技术服务
提供公共卫生咨询、检验、健康安全评价等技术服务。
【工作模式】
管理模式：基础防治规范化；重点立题项目化；合作协调网络化；社区服务综合化。
工作方式：现场与实验室相结合；管理与技术指导相结合；预防与临床诊疗相结合；试点与应用推广相结合。
防治结合：疾控中心负责疾病预防控制业务归口管理，医疗机构开展规范化诊疗，社区卫生服务中心负责社区病人和高危人群管理。

上海市预防医学研究院是政府投入为主的公益性研究机构。由上海市疾病预防控制中心主要业务科室、若干核心研究室和重点实验室组成，是以开展预防医学应用研究，提高卫生防病实施技术，加快公共卫生人才培养为目标的科研机构，主要承担各类传染性疾病和非传染性疾病的预防控制应用研究，以及对环境、职业、营养不良等健康危害因素的识别、评价控制的研究。为提高疾病预防控制水平提供技术支持。
【职责定位】
跟踪国际科学前沿，针对国内和本市的公共卫生健康问题，制定和更新预防医学研究的方向和目标，并发布相应指南文件；组织、实施和研究计划，并对其进行管理和考核；提供国内外医学研究信息和动态，制定各类卫生标准和技术规范，开展专业咨询和培训；建立内外合作和交流，开发和利用公共卫生资源。
【公共卫生研究平台建设】
1、实验室平台：以预防医学研究院现有实验室资源为基础，充分利用中心的先进设备条件构建国内领先、国际先进的科研实验室平台，同时共同组建本市的合作实验室、国内国际间合作实验室、国际实验工作站等模式的实验室体系，资源共享；共同开展公共卫生重大项目研究，开展不明原因病原微生物研究和化学危害物研究。
2、信息平台：收集国内外医学情报资料，建立信息量大、更新速度快、获取较为系统的生物医学信息库。为预防医学和公共卫生研究与建设提供服务；开展疾病综合监测分析、公共卫生预警和突发事件处理研究。
3．评估决策平台：提供各类健康及危险评估所需的基础信息，建立评估的规范和方法；开展信息综合和策略研究，建立流行病学支持系统，为院内外研究项目提供流行病学方法支持。
4．预防医学应用研究平台：确立以传染病与慢性病防治、病原微生物、环境与职业卫生、卫生毒理学和食源性疾病为主的预防医学研究重点，使部分学科研究达到国内领先，接近国际先进水平。以此带动其它公共卫生研究水平的提高。同时开展各类卫生标准、技术规范的制定及推广实施；开展公共卫生管理、卫生经济、社会医学和公共卫生政策研究；实施临床预防项目，开展防治效果的评估。
【核心研究室】
艾滋病病毒免疫研究室
病原微生物检测平台与应用研究室
公共卫生基因与蛋白质组学研究室
结核病分子生物学研究室
病媒生物抗药性研究室
肿瘤流行病学研究室
心血管病流行病学研究室
毒理学评价研究室
化妆品安全与功能研究室
环境与健康研究室
职业危害预防与控制研究室
公共卫生化学分析研究室
寄生虫病研究室
领导信息

付 晨 1974年出生，中共党员，硕士，研究员。现任上海市疾病预防控制中心主任、中心党委副书记，主持中心行政全面工作，分管慢性非传染性疾病与伤害防治、外事、信息等工作。

现担任复旦大学公共卫生学院兼职教授、上海交通大学公共卫生学院特聘教授、上海市政府发展研究中心特约研究员、上海市预防医学会副会长/理事、上海市青年联合会常委和医药卫生界别主任、上海市法学会卫生法学研究会常务理事、上海市医药卫生青联副主席、上海市疾病预防控制信息标委会主任委员、上海市卫生信息标委会副主任委员、上海市公共卫生监督技术服务质控中心主任、上海市医务工会副主席。

宋耀君 1961年出生，中共党员，大学本科，副主任医师。现任上海市疾病预防控制中心党委书记，主持中心党委全面工作，分管组织人事、办公室工作。

现担任中国卫生计生思想政治工作促进会理事、中国卫生计生思想政治工作促进会疾病预防控制分会副会长、上海市医学伦理学会常务理事、上海市第十五届人大代表。

郭常义 1961年出生，中共党员，本科，主任医师。现任上海市疾病预防控制中心副主任，分管中心财务、质量管理、生物安全、菌毒种管理、五大卫生等工作。

现担任中华预防医学会环境卫生委员会常务理事、上海市预防医学会常务理事、中国卫生监督协会专家咨询委员会委员、中国卫生监督协会理事会第一届理事、中国卫生监督协会环境卫生与健康专业委员会、放射卫生专业委员会、卫生产品安全专业委员会常务委员、中国卫生监督协会团体标准委员会环境与健康标委会副主任委员、上海市卫生监督标准化技术委员会副主任、上海市学校卫生保健协会副主任。

袁政安 1965年出生，中共党员，本科，主任医师。现任上海市疾病预防控制中心党委副书记、纪委书记，分管中心团委、妇委、纪检监察、病原生物检定、公共服务与健康安全评价等工作。

先后担任中国防痨协会副理事长、上海市防痨协会理事长、上海市医学会卫生分会主任委员、上海市预防医学会公共卫生应急支委会主任委员、中国卫生信息协会健康统计支委会副主任委员。

潘启超 1963年出生，无党派人士，本科，主任医师。现任上海市疾病预防控制中心副主任兼结核病和艾滋病防治所所长，分管综合保障、交流培训、科研、结核病艾滋病防治等工作。

先后担任卫生部艾滋病专家咨询委员会委员、上海市预防医学会流行病学会副主任委员、上海市预防医学会性病艾滋病专业委员会主任委员。

孙晓冬 1968年出生，中共党员，博士，主任医师。现任上海市疾病预防控制中心副主任，分管业务综合管理、卫生应急、传染病防治、免疫规划等工作。

现担任上海市预防医学会免疫规划专委会主委、中华预防医学会疫苗与免疫分会第一届委员会常务委员、中华医学会儿科学分会预防接种委员会副主委、华东免疫预防协作委员会委员。