中华人民共和国张家港海事局隶属于中华人民共和国江苏海事局，实行垂直管理体制，根据法律、法规的授权，负责行使辖区水上安全监督、防止船舶污染、口岸开放监管和行政执法等职能。

通航水域管辖范围为：（一）福姜沙水道、浏海沙水道——上界：大河港与螃蜞港联线，下界：通西整治建筑物上端与华能南通电厂直接输煤码头上端联线；北界：双涧沙整治建筑物南潜堤至双涧沙头部潜堤至长江FB#12-1左右通航浮至长江FB#13黑浮及以上黑浮联线至上界相交处联线（含福中水道）；泓北沙港池口门下端至长江#38-1左右通航浮至长沙洲尾联线；华能南通电厂直接输煤码头上端至沪通长江大桥#26桥墩下端及向正西至横港沙联线。（二）通州沙西水域——东界：通州沙西侧的通西整治建筑物及其下端点至下界狼山沙联线；下界：福山塘下端至南通一德码头上端联线。

陆域管辖范围为：长山（久盛船业上端）至福山塘张家港市行政区域内的陆域岸线，张家港市行政区域内的江心洲陆域岸线。

目前，全局共设有办公室、人事教育处、装备信息处、财务会计处、指挥中心（搜救中心办公室）、通航管理处、执法督察处、船舶监督处、危管防污处、党群工作部（纪检监察处）10个内设机构，政务中心、船舶交通管理中心、海巡执法支队3个处室办事机构，港区海事处、锦丰海事处2个派出机构。