沈阳市税务局第二稽查局承担市税务局列名大企业的税务稽查、税收高风险事项应对和协查等工作；负责高新技术产业开发区税务局、中国（辽宁）自由贸易试验区沈阳片区税务局、和平区税务局、浑南区税务局、苏家屯区税务局、康平县税务局所辖区域内税收、社会保险费和有关非税收入违法案件的查处以及查办案件的执行工作。