1、申请材料不同；
个人商标需要提供个体户工商执照（加盖公章或者签名)以及身份证复印件，企业申请商标需提供加盖公章的营业执照。
2、财产所有权不同；
个人商标属于私人财产，与企业财产无关系，企业商标属于公司财产的一部分，如果公司破产，那么商标作为资产要进行拍卖抵债。
比如一个公司有三个合伙人，使用的商标属于个人，公司使用商标的话需要被许可，如果发生股权方面的纠纷，公司会因为商标受制于人。
3、变更程序繁琐程度不一样；
企业商标如果改变注册地址或名称，商标局规定必须进行变更。个人商标因为申请时依据的是身份证号码，具有唯一性，而且商标局对地址的要求没有严格限制，这一点方便很多。
笔者认为，随着知识产权制度的完善与规范，过去那种几个把兄弟随便商量就注册商标成立公司的时代已经过去了，尤其是合伙人公司以及一些家族企业，对注册商标的主体更要慎重选择，以免公司发展壮大后，发生不必要的商标权纠纷。
