承担预算管理单位预决算、财务、资产管理和内部审计工作，负责卫生健康对口支援工作。负责机关财务管理工作。

负责局机关及所属单位的机构编制、人事管理和队伍建设等工作。拟订全市卫生健康人才发展政策并组织实施。拟订卫生健康科技发展规划以及相关政策并组织实施。承担实验室生物安全监督工作。组织开展住院医师、专科医师培训等毕业后医学教育和继续教育工作，协同指导医学院校教育。组织指导卫生健康领域的对外交流与合作、对外宣传、援外工作，开展与港澳台地区的交流与合作。承担局机关及所属单位外事管理工作。负责局机关离退休人员的管理服务工作，指导所属单位离退休人员的管理服务工作。

组织开展卫生健康宣传、健康教育、健康促进行动，承担卫生健康科学普及、新闻和信息发布工作。

负责局机关及直属单位党的建设和群团工作，指导本行业社会组织党建相关工作。

负责文电、会务、督查、机要、保密、档案、值班等机关日常运转，承担政府信息和政务公开、建议提案办理等有关工作。