资源监管科
负责人：
初永忠
办公电话：0535-3091689
机构职能：
负责国家级海洋公园、国家级水产种质资源保护区、长山尾地质遗迹省级海洋特别保护区和庙岛群岛海豹省级自然保护区等保护地的管护、研究工作；开展保护地内海洋资源基础调查和经常性监测评估工作；加强珍稀濒危斑海豹等海洋生物保护；进行斑海豹迁徙和生活习性的研究。
发展规划科
负责人：
李衍祥
办公电话：0535-3091629
机构职能：
承担各类自然保护地统筹协调工作；按照国家公园评审标准，开展创建国家公园的调研、论证、申报等筹备工作。
综合科
负责人：
于恩亮
办公电话：0535-3091626
机构职能：
负责单位党的建设工作；承担单位日常工作的综合协调和管理服务；负责单位文电、会务、督查、信息、宣传、机要、保密、档案、信访、应急、安全、考核等工作；承担政务公开、综合文稿起草等工作；负责单位财务、国有资产管理工作；负责单位的精神文明建设、人事管理、机构编制、后勤保障、离退休人员管理服务和教育培训等工作；承担自然保护地科研、宣传等工作。
