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2、综合规划科
会同有关部门组织拟订全市综合交通运输体系规划，承担有关协调工作；组织拟订相关行业发展战略和规划，参与拟订全市物流业发展战略和规划；承担有关规划和建设项目的前期审核工作；提出全市公路、水路固定资产投资规模和方向、国家和省、市财政性资金安排建议并监督实施；承担或参与全市权限内公路、水路工程设计审批；拟订公路、水路建设相关技术标准；承担有关环境保护、利用外资、统计、信息等工作，监测分析交通运输运行情况并发布有关信息；负责全市公路收费站点设置工作。
电话：0379-63280198

3、技术安全科
管理和指导全市交通科技工作，拟订全市交通行业科技发展政策和规划并监督实施，指导行业网络安全工作，负责交通科技项目的申报、立项和实施；参与管理交通行业标准和计量工作；指导行业生态文明和节能减排工作；负责绿色交通示范项目创建工作；组织拟订全市公路、水路安全生产政策和应急预案并监督实施；指导有关安全生产和应急管理机制建设；承担有关道路、水路运输企业安全生产监督工作；依法组织或参与有关事故调查处理工作；组织协调国家重点物资运输和紧急客货运输，负责安全信息统计、分析、报送等工作；指导全市交通运输系统消防反恐工作。
电话：0379-63210636

4、运输管理科
指导培育全市道路、水路运输市场发展；参与拟订相关政策、制度和标准并监督实施；指导全市有关道路、水路运输安全生产监督管理工作；负责与有关部门建立综合交通运输体系协调配合机制；做好运输体系相关协调工作；指导全市运输线路、营运车辆、交通枢纽、运输场站等管理工作；参与拟订物流发展有关政策和标准；指导车辆维修、营运车辆综合性能检测、机动车驾驶员培训机构和驾驶员培训工作；指导协调公共汽车、出租汽车、汽车租赁、道路客运工作。
电话：0379-63239386

5、政策法规科
承担有关地方性法规、规章草案起草工作；承担机关有关规范性文件合法性审查和清理工作；组织开展法制宣传教育；负责行政执法监督工作；承担行政复议、行政应诉有关工作；指导行业信用管理工作；组织开展相关政策研究，承担综合交通运输体制改革有关工作。
电话：0379-63239687

6、公交管理科
负责城市公共交通客运的监督；负责城市公共交通客运特许经营协议的拟订、签订一级协议的监督实施；负责城市公共交通客运线路的审批，指导公交站牌及站名的设置；负责督促城市公共交通企业按照有关规范和标准提供优质服务；负责涉及城市公共交通发展的相关协调工作；协助城市公共交通企业抓好安全生产工作。
电话：0379-63239893

7、港航管理科
负责通航水域交通安全监督管理工作；渡口设置、撤销审批；航道的规划建设与管理等工作；负责全市船舶检验工作。
电话：0379-63239965

8、行政审批科
根据授权统一办理本部门有关行政审批事项。
电话：0379-63239770

9、财务审计科
拟订全市公路、水路行业有关投融资政策；承担专项资金、预决算、政府采购、外资、信贷有关工作；承担机关和直属单位财务管理和内部审计工作。
电话：0379-63239356

10、建设管理科
承担全市公路、水路建设市场监管责任；负责公路、水路建设、维护相关政策、制度、技术标准并监督实施；承担市重点公路、水路等工程施工许可、实施监督和竣工验收工作；指导全市公路、水路建设、管理和维护工作。
电话：0379-63250524

11、人事教育科
承担机关和直属单位的干部人事、机构编制、工资福利、教育培训、和队伍建设工作，负责全市交通运输行业教育管理工作。
电话：0379-63239726

12、信访科
受理来信、接待来访，协调处理信访突出问题和群体性事件；承办相关部门和领导交办的信访事宜，督促检查重要信访事项的处理和落实，对当事人反映问题、请办事项的处理结果或一件归档保存。
电话：0379-63206158；