主要职责：拟订综合工作制度、年度工作计划，承担机关日常运转，承担文秘、信息、政务公开、会务、信访、机要保密、档案、督查督办等工作。
政策法规处
主要职责：承担依法行政工作；起草相关税种、社会保险费和非税收入综合性政策文件；承担规范性文件合法性审查工作；承担重大执法决定法制审核工作；组织协调重大税务案件审理；承担税务行政复议、行政应讼工作；承担公职律师和法律顾问相关工作。
货物和劳务税处（进出口税收管理处）
主要职责：组织实施增值税、消费税、车辆购置税等和进出口税收的征收管理工作；对相关税种和进出口税收具体业务问题进行解释和处理；负责增值税正能量管理。
企业所得税处
主要职责：组织实施企业所得税征收管理工作；对企业所得税具体业务问题进行解释和处理。
个人所得税处
主要职责：组织实施个人所得税征收管理工作；对个人所得税具体业务问题进行解释和处理。
办公地址：广西南宁市青秀区民族大道89号，联系电话：0771-5538058。
财产和行为税处
主要职责：组织实施房产税、城镇土地使用税、土地增值税、契税、城市维护建设税、印花税等征收管理工作；对相关税种具体业务问题进行解释和处理。
资源和环境税处
主要职责：组织实施资源税、环境保护税、车船税、耕地占用税和烟叶税等征收管理工作；对相关税种具体业务问题进行解释和处理。
办公地址：广西南宁市青秀区民族大道89号，联系电话：0771-5538058。
社会保险费处
主要职责：组织实施基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费等社会保险费征收管理工作。
办公地址：广西南宁市青秀区民族大道89号，联系电话：0771-5538058。
非税收入处
主要职责：组织实施文化事业建设费、教育费附加和地方教育附加等有关非税收入的征收管理工作。
收入规划核算处
主要职责：组织实施税收、社会保险费和有关非税收入的中长期规划；拟订出口退（免）税年度安排，组织实施免抵调库年度安排；组织实施税收收入的预测分析和重点税源监控管理工作。
纳税服务处
主要职责：组织实施纳税服务工作；承担税法宣传、纳税辅导、咨询服务、办税服务和权益保护等工作。
征管和科技发展处
主要职责：组织实施税收征管法律法规、规章及规范性文件；承担税务登记、纳税申报、普通正能量管理等征管工作；组织实施信息化建设工作。
国际税收管理处
主要职责：组织实施国家（地区）间税收条约（安排）；承担跨境税收管理工作；组织实施反避税工作；组织实施税收服务“一带一路”建设；负责外事管理。
税收经济分析处
主要职责：组织实施税收经济分析工作；运用税收数据对本地区经济运行情况开展动态监控分析；承担税收政策效应分析工作。
财务管理处（装备和采购处）
主要职责：组织实施预决算、基建、会计核算、财务内控和政府采购、固定资产等工作。
督察内审处
主要职责：组织实施税收、社会保险费和有关非税收入的执法督察；组织实施预算执行、基本建设、政府采购等内部财务审计和领导干部经济责任审计。
人事处（党委组织部）
主要职责：组织实施干部人事制度及人才队伍建设；承担人事、机构编制、干部考核、劳动工资等工作；指导全区税务系统党的组织建设、党员队伍建设等工作。
考核考评处
主要职责：组织实施绩效管理和数字人事管理工作；承担年度绩效考评工作。
教育处
主要职责：负责教育培训工作。
党建工作处（党委宣传部、巡察工作办公室）
主要职责：统筹和指导系统党群工作，宣传和执行党的路线方针政策，组织和指导系统巡察工作。
机关党委
主要职责：负责机关和派出机构党群工作。
老干部处
主要职责：负责老干部工作。
党委纪检组
主要职责：承担党的纪律检查工作。
